Aunque la situación actual del pueblo es más reciente, en otras partes del término se han encontrado restos de dos poblados ibero-romanos que por desgracia no han sido suficientemente estudiados todavía. Estos poblados estaban situados en lo que hoy se conoce como Arbir y la Malena.

El primero de ellos se cree que data de la Primera Edad del Hierro (entre el año 600 a. de C. y el comienzo de nuestra Era).

El segundo se cree que fue un antiguo poblado ibero-romano de grandes dimensiones y que subsistió hasta la Alta Edad Media, (siglos IX a XI de la Era actual). Según escritos de los siglos II y III, cabe la posibilidad de que cerca de este poblado pasara una vía romana y que dicho yacimiento pudieran ser los restos de la ciudad romana Bernama o Bernaba, sin embargo, por falta de un estudio más profundo no se puede conocer la veracidad de estas afirmaciones.

El propio nombre del pueblo sugiere que el asentamiento actual de la población es de origen árabe. Esto nos llevaría más o menos al siglo VIII. Se cree que Moyuela pudo originarse como punto de defensa en esta época.

A finales del siglo XI o comienzos del XII, Moyuela pasaría a manos cristianas y es en el año 1279-80 cuando aparece el primer documento en el cual figura el nombre de Moyuela.

Durante los siglos XV a XVIII tiene lugar el momento de mayor desarrollo del pueblo. De estos años son la mayoría de los monumentos de interés de la población.

En 1833, se encuadra a Moyuela dentro de la provincia de Zaragoza y en 1834 se constituye el Ayuntamiento.

Del siglo XIX caben destacar las Guerras Carlistas y la epidemia de cólera en 1885.

En el siglo XX llegará una mejora de las comunicaciones, la energía eléctrica, la mejora de la infraestructura viaria, la mecanización de la agricultura y la red de agua potable por todo el pueblo.

Como contrapartida, en este siglo habrá fuertes tensiones políticas que culminarán con la Guerra Civil y posteriormente tendrá lugar un gran éxodo masivo a las grandes ciudades y por lo tanto un alarmante descenso de la población.